Lékařskou pohotovostní službou jsou pověřeny nemocnice založené Zlínským krajem (Krajská nemocnice T. Bati, a. s., Uherskohradišťská nemocnice a.s., Kroměřížská nemocnice a.s. a Vsetínská nemocnice a.s.). Pro oblast Valašského Meziříčí bude pohotovost zajišťovat Nemocnice Valašské Meziříčí, a.s. Zbývající oblasti Zlínské kraje budou zajištěny prostřednictvím Zdravotnické záchranné služby Zlínského kraje. V roce 2018 budou uzavřeny smlouvy o poskytnutí vyrovnávací platby s Krajskou nemocnicí T. Bati, a. s. ve výši 4.100.000,- Kč, Uherskohradišťskou nemocnicí a. s. ve výši 2.300.000, Kroměřížskou nemocnicí a. s. ve výši 2.300.000, Vsetínskou nemocnicí a.s. ve výši 3.400.000 a Nemocnicí Valašské Meziříčí, a. s. ve výši 1.000.000. Lékařská pohotovostní služba ve Valašských Kloboucích, v Bystřici pod Hostýnem, v Uherském Brodě a v Rožnově pod Radhoštěm bude i nadále provozována Zdravotnickou záchrannou službou Zlínského kraje.

Protialkoholní a protitoxikomanickou záchytnou stanici provozuje Kroměřížská nemocnice a.s., které bude poskytnuta vyrovnávací platba ve výši 8.300.000,- Kč. Ošetřeným osobám bude účtována cena za záchyt v minimální výši 1.300 Kč. U této ceny dochází ke zvýšení oproti aktuální výši o 350 Kč. Rozpočet počítá s růstem nákladů na službu zejména v důsledku růstu mzdových nákladů (od 1. 1. 2018 se předpokládá navýšení tarifních mezd zdravotnických pracovníků o 10 %).

Středisko vědeckých informací Krajské nemocnice T. Bati, a. s. funguje jako knihovnické i informační pracoviště pro oblast lékařství a zdravotnictví v celém Zlínském kraji. Vzhledem k vysoce specializovanému zaměření má veřejnost zájem o jej navštěvovat. Tato činnost je pro nemocnici ztrátová, proto Zlínský kraj poskytne nemocnici dotaci ve výši 660.000,- Kč.

Účelem vyrovnávací platby je dokrytí ztráty, která při výkonu služeb obecného hospodářského zájmu vzniká, maximálně však do částky stanovené Zastupitelstvem Zlínského kraje. Konkrétní podmínky vyrovnávací platby, tedy zejm. výši, ale také splatnost, vyúčtování, kontrolu aj. stanoví Zlínský kraj v samostatných smlouvách o poskytnutí vyrovnávacích plateb vždy na kalendářní rok k jednotlivým službám obecného hospodářského zájmu.